Bernd Franz Lang
Génomique, bio-informatique et évolution
Profile
Research expertise
Thèmes
- Bactéries et champignons symbiotiques
- Génomes et évolution de gènes
- Bioinformatique, génomique, transcriptomique et protéomique
BACTÉRIES ET CHAMPIGNONS SYMBIOTIQUES
Les organismes multicellulaires comme les plantes et les animaux interagissent fréquemment avec des microbes symbiotiques. Ces derniers vont de bénéfiques à pathogènes et peuvent vivre dans les tissus, dans les cellules, ou au contact externe. Nous nous intéressons particulièrement aux symbiotes bénéfiques aux végétaux, afin de comprendre comment ils coopèrent avec leur hôte, au moyen du séquençage et de l’analyse de leurs génomes, transcriptomes et protéomes. Ce projet est d’une grande portée pour une agriculture durable - le remplacement des produits agro-chimiques par les bio-pesticides et les engrais minéraux par la bio-fertilisation.
GÉNOMES ET EVOLUTION DE GÈNES
Comprendre l'architecture du génome, le contenu en gènes et l'expression génique - dans un contexte évolutif - est à la base de la compréhension des organismes vivants. Nous nous intéressons à un large éventail de bactéries, champignons et eucaryotes unicellulaires, particulièrement les espèces symbiotiques des plantes, de même qu’aux eucaryotes primitifs nous permettant de retracer l'origine des eucaryotes. Notre approche par génomique comparative nous permet d'identifier régulièrement des mécanismes moléculaires innovants, tels l'édition d'ARN, l'épissage en trans, ou le saut de ribosome.
OUTILS BIO-INFORMATIQUES POUR L’ANALYSE DE GÉNOMES
Nous développons des stratégies/procédures/outils bio-informatiques pour l'assemblage de génomes, la reconnaissance de gènes, l'annotation fonctionnelle de génomes. Notre recherche est multidisciplinaire, et basée sur des collaborations nationales et internationales.
Awards and recognitions
- Société royale du Canada : Les Académies des arts, des lettres et des sciences du Canada 2015 - Société royale du Canada
For more information…
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29-05-2015 Mitochondrie, l'étranger dans la maison
Des scientifiques, dont quatre professeurs de l'Université de Montréal, ont participé à un programme audio d'éducation citoyenne portant sur la mitochondrie. Diffusé sous forme de podcast, il comporte quatre épisodes de 20 mn environ.
- 08-09-2015 Quatre professeurs entrent à la Société royale du Canada
Affiliations and responsabilities
Research affiliations
Teaching and supervision
Teaching
Courses taught (current session only)
- BCM-3532 – Stage en laboratoire de recherche
- BCM-3533 – Stage en génétique et génomique
- BCM-3536 – Proposition de recherche en biochimie
- BIN-3005 – Stage en laboratoire de recherche
Programs
Student supervision
Theses and dissertation supervision (Papyrus Institutional Repository)
Séquençage des génomes nucléaires d’eucaryotes unicellulaires ‘primitifs’ : les jakobides
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Microbial endophytes and their interactions with cranberry plants
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Caractérisation moléculaire des micro-organismes endophytes de la canneberge (Vaccinium macrocarpon Ait.)
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
Endophytes of commercial Cranberry cultivars that control fungal pathogens.
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
An approach to improved microbial eukaryotic genome annotation
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Développement de méthodes d'assemblage de génomes de novo adaptées aux bactéries endosymbiotes
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
La RNase P mitochondriale chez Neurospora crassa
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Supercomplexes multifonctionnels chez les mitochondries, et chez E. coli
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
A phylogenomics approach to resolving fungal evolution, and phylogenetic method development
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
Purification of mitochondrial RNase P in A. nidulans
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Une approche phylogénomique pour inférer l'évolution des eucaryotes
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
Évolution structurale et fonctionnelle de la composante ARN de la RNase P mitochondriale
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
Caractérisation structurale et fonctionnelle des ARNtm mitochondriaux de jakobides
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
L'évolution de l'édition des ARN de transfert chez les jakobides
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Étude phylogénétique d'[alpha]-protéobactéries : sur les traces de l'ancêtre bactérien de l'endosymbiote mitochondrial
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Phylogénie de l'édition des ARN de transfert mitochondriaux chez les chytridiomycètes
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
Mitochondrial evolution in the fission yeasts
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Les facteurs impliqués dans l'expression du génome mitochondrial de Reclinomonas americana : une description et une comparaison avec les facteurs procaryotes
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Évolution de la structure secondaire de la sous-unité d'ARN de la RNase P mitochondriale chez les Ascomycètes
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Séquence complète et analyse du génome mitochondrial du champignon inférieur Allomyces macrogynus
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
L'édition des ARN de transfert mitochondriaux du chytridiomycèrte Spizellomyces punctatus
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Projects
Research projects
Enhanced eukaryotic genome annotation by exploiting advanced experimental and computational technologies
Mitochondrial translation systems that break the rules
Genomique de l'endosymbiose
MYCATOK PROJECT: INNOVATING CRANBERRY FARMING WITH BENEFICIAL SYMBIOTIC MICROBES
Drop-based microfluidics (DBM) for single cell studies and ultrahighthroughput phenotypic screens and lab evolution
Génomique comparative d’une lignée d’eucaryotes ancienne: les jakobides
Supplément COVID-19 CRSNG_Mitochondrial translation systems that break the rules
Prédiction automatique de modifications du code génétique et de l’ARN messager
Investigation of systematic errors in genome assembly algorithms
Genomique de l'endosymbiose
STRUCTURE AND EVOLUTION OF MITOCHONDRIAL RNASE P
EVOLUTION DES GENES D'ARN DE TRANSFERT A L'ECHELLE GENOMIQUE
CHAIRE DE RECHERCHE DU CANADA EN GENOMIQUE COMPARATIVE ET EVOLUTIVE
OPTIMISATION REPRODUCTIVE: LE ROLE DU GUIDAGE DES TUBES POLLINIQUES DANS LA PREVENTION DES CROISEMENTS INTERSPECIFIQUES ET LA SPECIATION CHEZ LES PLANTES
GENOREM IMPROVING BIOREMEDIATION OF POLLUTED SOILS THROUGH ENVIRONMENTAL GENOMICS
STRUCTURE AND EVOLUTION OF MITOCHONDRIAL RNASE P
A BIOFERTILIZER MANAGEMENT STRATEGY FOR SUSTAINABLE CRANBERRY PRODUCTION, USING BIOCHAR TOGETHER WITH BENEFICIAL MICROBES
DEVELOPING MYCORRHIZAL GENOMIC MARKERS TO ENHANCE INDUSTRIAL PRODUCTION AND FORMULATION
Outreach
Publications and presentations
Publications
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Lang BF, et al. , Burger G, Nosek J (2014). Massive programmed translational jumping in mitochondria. Proc Natl Acad Sci U S A. 111:5926-31
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Burger G, Gray MW, Forget L, Lang BF (2013). A strikingly bacteria-like and gene-rich mitochondrial genome is a hallmark of jakobid protists. Genome Biol Evol 5:418
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Derelle R and BF Lang (2011). Rooting the eukaryotic tree with mitochondrial and bacterial proteins. Mol Biol Evol 29:1277-1289.
https://scholar.google.ca/scholar?q=lang+bf
Disciplines
- Biochemistry
- Genomics
- Genetics
- Bioinformatics
Areas of expertise
- Nucleic Acids
- Cell
- Chromosome (Living Organisms)
- Enzymes and Proteins
- Evolution and Phylogenesis
- Gene (Living Organisms)
- Biological and Biochemical Mechanisms
- Bioactive Molecules
- Bacteria
- Genome
- Genes
- Genomics
- Proteomics