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Health Sciences

Daniel Sinnett

Déterminants génétiques de la leucémie de l’enfant

Professeur titulaire

Faculté de médecine - Département de pédiatrie

514 345-4931

daniel.sinnett@umontreal.ca

Secondary numbers: 514 345-4931 #2990 (Travail 1) 514 345-4731 (Télécopieur)

Profile

Research expertise

Leukemogenesis and tumor suppressor genes

Oncogenesis is a multistep process that involves the accumulation of mutations in oncogenes and tumor suppressor genes. The short arm of chromosome 12 is affected by genetic rearrangements leading to the loss of genetic material in a wide range of hematological malignancies. It has been shown that chromosome 12p12.3 is associated with a putative tumor suppressor that may play an important in childhood leukemogenesis as well as in certain solid neoplasias. The transcription factor ETV6 is a suitable candidate gene. In this project, we propose to characterize ETV6 by identifying the genes targeted by this transcription repressor in order to build the corresponding regulatory network and by determining the nature of the protein partners involved in the repression complex.Genetic determinants of childhood leukemiaSporadic cancer is a complex disease, where the effect of the environment is modulated by a series of genes whose allelic forms represent functional polymorphisms (DNA variants). According to this model, the origin of childhood leukemia could be explained by a combination of genetic susceptibility factors and environmental exposures. Because of the much shorter latency period, the study of pediatric tumors allows a more realistic evaluation of the input of genetic factors and environment exposures during vulnerable periods of development (foetal life and young childhood). In this project, we propose to identify the genetic factors underlying the individual’s susceptibility to childhood leukemia by performing genetic epidemiology studies.Regulatory genomicsGenetic diversity in regulatory sequences might lead to allelic variation in gene expression levels (quantitative changes). Such variability could alter tightly regulated biological pathways (e.g. cell cycle) and then contribute to change in disease risk. In this project, we propose to determine the extent of genetic variants in regulatory regions and to validate the functional impact of these variants.

Teaching and supervision

Student supervision

Theses and dissertation supervision (Papyrus Institutional Repository)

2018

L’implication de la peptide-déformylase (PDF) dans la leucémie aiguë lymphoblastique de l’enfant

Graduate : Jimenez Cortes, Camille
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
2018

Impact de SRP72 sur le facteur de transcription ETV6 dans la leucémie aiguë lymphoblastique

Graduate : Fuchs, Claire
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
2017

Caractérisation du microDNome et sa modulation par le traitement anti-cancer

Graduate : Mehanna, Pamela
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
2017

Paysage génomique de la leucémie aiguë lymphoblastique de l’enfant

Graduate : Spinella, Jean-François
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
2009

Impacts fonctionnels des polymorphismes dans les promoteurs des gènes de l’apoptose

Graduate : Lalonde, Marie-Eve
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
2008

Détection et caractérisation des interactions dans les maladies complexes

Graduate : St-Onge, Pascal
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
2006

Identification de transcrits modulés par ETV6 : un gène candidat suppresseur de tumeur

Graduate : Boily, Gino
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
2003

Variabilité génétique au niveau des gènes de réparation de l'ADN

Graduate : Meloche, Caroline
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.

Projects

Research projects

2015 - 2023

Vascular remodeling in hypertension and cardiometabolic disease: from mice to humans.

Lead researcher : Ernesto Luis Schiffrin
Co-researchers : Daniel Sinnett
Funding sources: IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs:
2015 - 2022

CALCUL QUEBEC

Lead researcher : Paul Charbonneau , Timothée Poisot
Co-researchers : Jesse Shapiro , Mohamed Hijri , Daniel Sinnett , Mark E. Samuels , Laurent J. Lewis , Normand Mousseau , Anne Bruneau , Georges Michaud , François Schiettekatte , Rémy Sauvé , Michel Côté , Pierre-Louis Bellec , Damian Labuda , Jacques Drouin , Louis Jean Dubé , Guy Dumas , Marc Parizeau , Louis Pérusse , Alain De Champlain , Daniel Reinharz , Hugo Martel , Christian Gagné , Arnaud Droit , Frédéric Maps , R Platt , Alan C Evans , W Robert J Funnell , Hong Guo , Victoria Kaspi , Sang Yong Jeon , Nikolas Provatas , Russell Davidson , Jackalyn Marie Vogel , Nicolas Moitessier , Guy Moore , Sivakumaran Nadarajah , Abdelkader Baggag , Erica Moodie , Jacek A. Majewski , Andrew Piper , Luc Mongeau , Guillaume Bourque , Stefan Sinclair , Daniel Joseph Kirshbaum , Jun Song , Brigitte Jaumard , Jean-Yves Trépanier , François Guibault , François Bertrand , Alain Rochefort , Frédéric Sirois , Éric Laurendeau , Georges Dionne , Wagdi Habashi , G. Peslherbe , Thomas Fevens , Marius Paraschivoiu , Ali Dolatabadi , André Dieter Bandrauk , André-Marie Tremblay , Pierre Proulx , Noureddine Atalla , David Sénéchal , Armand Soldera , Kalifa Goïta , Alexandre Blais , Claude Legault , Stéphane Moreau , Hugo Larochelle , Pierre-Étienne Jacques , Gabriel Crainic , René Laprise , Pierre Gauthier , Laxmi Sushama , Simon Guillotte , Adam Skorek , Patrizio Antici , Dany Dumont , François Vidal , Jannette Frandsen , Lorne Archie Nelson , Martin Aube , Leandro Coelho
Funding sources: FRQNT/Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FQRNT)
Grant programs: PVXXXXXX-(RS) Programme de regroupements stratégiques
2018 - 2021

Characterization of childhood acute lymphoblastic leukemia-specific long non-...

Lead researcher : Daniel Sinnett
Funding sources: IRSCC/Institut de recherche de la Société canadienne du cancer
Grant programs: PVX12154-Subvention de recherche
2016 - 2021

Projet VIE : Valorisation, implication, éducation

Lead researcher : Daniel Sinnett
Funding sources: Fondation Charles Bruneau
Grant programs:
2019 - 2020

Characterization of childhood acute lymphoblastic leukemia-specific long non-coding RNAs (the "Project")

Lead researcher : Éric Lécuyer
Co-researchers : Daniel Sinnett
Funding sources: IRSCC/Institut de recherche de la Société canadienne du cancer
Grant programs:
2018 - 2020

Gut microbiota and pediatric cancer: filling the gap.

Lead researcher : Valérie Marcil
Co-researchers : Daniel Sinnett , Caroline Laverdière
Funding sources: SRC/Société de recherche sur le cancer
Grant programs: PVX12154-Subvention de recherche
2018 - 2020

Profilage de la méthylation des pharmacogènes pendant le traitement de la leucémie lymphoblastique aiguë chez l'enfant

Lead researcher : Isabelle Laverdière
Co-researchers : Serge McGraw , Daniel Sinnett , Maja Krajinovic
Funding sources: SRC/Société de recherche sur le cancer
Grant programs: PVX12154-Subvention de recherche
2017 - 2019

Pharmacogenetics markers for treatment individualization in childhood patients with acute lymphoblastic leukemia

Lead researcher : Maja Krajinovic
Co-researchers : Daniel Sinnett , Caroline Laverdière
Funding sources: SRC/Société de recherche sur le cancer
Grant programs: PVX12154-Subvention de recherche
2014 - 2019

Programme de thérapies ciblées et adaptées à des sous-groupes de patients à haut risque, qui ne répondent pas aux traitements existants et pour lesquels il n'existe pas d'alternative thérapeutique.

Lead researcher : Daniel Sinnett
Funding sources: Fondation Des Gouverneurs De L'espoir
Grant programs:
2017 - 2018

Development of single-cell RNA-seq strategy to study childhood leukemia heterogeneity a pilot study.

Lead researcher : Daniel Sinnett
Funding sources: Fondation Charles Bruneau
Grant programs:
2016 - 2018

Réseau de médecine génétique appliquée (RMGA).

Lead researcher : Daniel Sinnett
Funding sources: FRQS/Fonds de recherche du Québec - Santé (FRSQ)
Grant programs: PVXXXXXX-Réseaux thématiques de recherche
2016 - 2017

The Terry Fox Precision Oncology for Young people (PROFYLE) Program.

Co-researchers : Daniel Sinnett
Funding sources: Terry Fox Research Institute
Grant programs:
2016 - 2017

Attribution d’une subvention du Réseau de Médecine Génétique Appliquée (RMGA)

Co-researchers : Daniel Sinnett
Funding sources: FRQS/Fonds de recherche du Québec - Santé (FRSQ)
Grant programs: PVXXXXXX-Réseaux thématiques de recherche
2016 - 2017

The Terry Fox Precision Oncology for Young people (PROFYLE) Program.

Co-researchers : Daniel Sinnett
Funding sources: Terry Fox Research Institute
Grant programs:
2016 - 2017

Plateforme ELISpot et Luminex

Lead researcher : Daniel Sinnett
Co-researchers : Hugo Soudeyns
Funding sources: Fondation Charles Bruneau
Grant programs:
2016 - 2017

Service de bioinformatique appliquée.

Lead researcher : Daniel Sinnett
Funding sources: Fondation Charles Bruneau
Grant programs:
2016 - 2017

Plateforme Biobanque de cancers pédiatriques

Lead researcher : Daniel Sinnett
Funding sources: Fondation Charles Bruneau
Grant programs:
2015 - 2017

Identification of novel therapeutic targets by functional genomic characterization of childhood acute lymphoblastic leukemia.

Lead researcher : Daniel Sinnett
Funding sources: LLS Canada/Leukemia and Lymphoma Society of Canada (The)
Grant programs: PVXX1862-Subvention de fonctionnement
2013 - 2017

CLINICAL EVALUATION OF SURFACE-PLASMON RESONANCE AND NANOPARTICLE-BASED FLUORESCENT DETECTION OF SERUM BIOMARKERS

Lead researcher : Joelle Pelletier
Funding sources: IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs: PVXXXXXX-(PRCS) Recherche concertée sur la santé (en partenariat avec le CRSNG)
2013 - 2017

GENOMIC DETERMINANTS OF COMMON LONG-TERM TREATMENT EFFECTS IN CHILDHOOD ACUTE LYMPHOBLASTIC LEUKEMIA SURVIVORS

Lead researcher : Daniel Sinnett
Funding sources: Pediatric Oncology Group of Ontario
Grant programs:
2013 - 2017

CLINICAL EVALUATION OF SURFACE-PLASMON RESONANCE AND NANOPARTICLE-BASED FLUORESCENT DETECTION OF SERUM BIOMARKERS

Lead researcher : Joelle Pelletier
Funding sources: CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs: PVXXXXXX-(PRCS/CHRP) Recherche en équipe concertée sur la santé avec l'appareillage (avec IRSC)
2015 - 2016

Stratégie de thérapies ciblées personnalisées dans les cancers réfractaires ou en rechute de l'enfant (Étude TRICEPS).

Lead researcher : Daniel Sinnett
Co-researchers : Sonia Cellot , Maja Krajinovic , Michel Duval
Funding sources: Ministère Économie et Innovation
Grant programs: PVXXXXXX-Soutien à la valorisation et au transfert (PSVT-v2): Soutien aux projets structurants
2015 - 2016

Plateforme Biobanque de cancers pédiatriques.

Lead researcher : Daniel Sinnett
Funding sources: Fondation Charles Bruneau
Grant programs:
2015 - 2016

Plateforme ELISpot et Luminex.

Lead researcher : Daniel Sinnett
Co-researchers : Hugo Soudeyns
Funding sources: Fondation Charles Bruneau
Grant programs:
2015 - 2016

Service de bioinformatique appliquée.

Lead researcher : Daniel Sinnett
Funding sources: Fondation Charles Bruneau
Grant programs:
2014 - 2016

LONG NONCODING RNAS DEREGULATED IN CHILDHOOD ACUTE LYMPHOBLASTIC LEUKEMIA

Lead researcher : Daniel Sinnett
Funding sources: IRSCC/Institut de recherche de la Société canadienne du cancer
Grant programs:
2013 - 2016

GENOMIC DETERMINANTS OF COMMON LONG-TERM TREATMENT EFFECTS IN CHILDHOOD ACUTE LYMPHOBLASTIC LEUKEMIA SURVIVORS

Lead researcher : Daniel Sinnett
Funding sources: The C17 Research Network: Children's Cancer & Blood Disorders
Grant programs:
2011 - 2016

GENOMIC DETERMINANTS OF COMMON LONG-TERM TREATMENT EFFECTS IN CHILDHOOD ACUTE LYMPHOBLASTIC LEUKEMIA SURVIVORS

Lead researcher : Daniel Sinnett
2011 - 2016

GENOMIC DETERMINANTS OF COMMON LONG-TERM TREATMENT EFFECTS IN CHILDHOOD ACUTE LYMPHOBLASTIC LEUKEMIA SURVIVORS

Lead researcher : Daniel Sinnett
Funding sources: IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs: PVXXXXXX-Subvention d'équipe
2010 - 2016

INVESTIGATION OF THE GENOMIC DETERMINANTS OF CHILDHOOD LEUKEMIA USING NEXT-GENERATION SEQUENCING

Lead researcher : Daniel Sinnett
Funding sources: IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs: PVXX5647-Subvention de fonctionnement incluant les subventions de fonctionnement programmatiques
2013 - 2015

MICRODNA - NOVEL SOURCE OF GENETIC VARIABILITY - ROLE IN SHAPING INDIVIDUAL SENSITIVITY TO CANCER TREATMENT.

Lead researcher : Maja Krajinovic
Co-researchers : Daniel Sinnett , Ivan Brukner
Funding sources: IRSCC/Institut de recherche de la Société canadienne du cancer
Grant programs:
2012 - 2015

GENOMIC DETERMINANTS OF COMMON LONG-TERM TREATMENT EFFECT IN CHILDHOOD ACUTE LYMPHOBLASTIC LEUKEMIA SURVIVORS

Lead researcher : Daniel Sinnett
Funding sources: SICK KIDS/The Hospital for Sick Children (Sick Kids)
Grant programs:
2012 - 2015

GENOMIC DETERMINANTS OF COMMON LONG-TERM TREATMENT EFFECTS IN CHILDHOOD ACUTE LYMPHOBLASTIC LEUKEMIA SURVIVORS

Lead researcher : Daniel Sinnett
Funding sources: SRC/Société de recherche sur le cancer
Grant programs:
2011 - 2015

SOUTIEN LOGISTIQUE/REDACTIONNEL - SALAIRE POUR PROFESSIONNEL #1

Lead researcher : Daniel Sinnett
Funding sources: Fondation Charles Bruneau
Grant programs:
2010 - 2015

INVESTIGATION OF THE GENOMIC DETERMINANTS OF CHILDHOOD LEUKEMIA USING NEXT-GENERATION SEQUENCING

Lead researcher : Daniel Sinnett
2011 - 2014

GENOMIC DETERMINANTS OF CHILDHOOD LEUKEMIA

Lead researcher : Daniel Sinnett
Funding sources: TFF/ Terry Fox Foundation/Fondation Terry Fox (La)
Grant programs:
2011 - 2014

RESEAU DE BIOBANQUES EN LEUCEMIE PEDIATRIQUE AU QUEBEC

Lead researcher : Daniel Sinnett
Co-researchers : Josée Hébert
Funding sources: Ministère Économie et Innovation
Grant programs: PVXXXXXX-Prog. soutien rech (PSR v1): Soutien à des projets de recherche
2010 - 2014

MONTREAL BIOBANK NETWORK FOR PEDIATRIC AND YOUNG ADULT LEUKEMIA : CORE 1 PROPOSAL - CHILDREN LEUKEMIA BANK

Lead researcher : Daniel Sinnett
Funding sources: COLE Foundation/Fondation Cole
Grant programs:
2010 - 2014

GENOMIC DETERMINANTS OF CHILDHOOD LEUKEMIA

Lead researcher : Daniel Sinnett
Funding sources: IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs: PVXXXXXX-Subvention d'équipe: programme nouvelles frontières Terry Fox en cancérologie
2010 - 2014

GENETIC DETERMINANTS OF THE RESISTANCE TO CORTICOSTEROIDS, VINCRISTINE AND ASPARAGINASE IN CHILDHOOD ACUTE LYMPHOBLASTIC LEUKEMIA

Lead researcher : Maja Krajinovic
Co-researchers : Daniel Sinnett , Caroline Laverdière , Marie-Hélène Roy-Gagnon
Funding sources: IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs: PVXX5647-Subvention de fonctionnement incluant les subventions de fonctionnement programmatiques
2009 - 2014

CIHR TEAM OF PREDICTION AND COMMUNICATION OF FAMILIAL RISK OF BREAST CANCER

Lead researcher : Jacques Simard
Co-researchers : Christine Maugard , Bernard Lespérance , Denise Avard , Daniel Sinnett
Funding sources: IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs:
2011 - 2013

GENOMICS OF CHILDHOOD LEUKEMIA

Lead researcher : Daniel Sinnett
Funding sources: FCI/Fondation canadienne pour l'innovation
Grant programs:
2011 - 2013

GENOMICS OF CHILDHOOD LEUKEMIA

Lead researcher : Daniel Sinnett
Funding sources: MSSS/Ministère de la Santé et des Services sociaux
Grant programs:
2011 - 2013

GENOMICS OF CHILDHOOD LEUKEMIA

Lead researcher : Daniel Sinnett
Funding sources: Regroupement de compagnies, corporations canadiennes
Grant programs:
2010 - 2013

GENOMIC DETERMINANTS OF CHILDHOOD LEUKEMIA

Lead researcher : Daniel Sinnett
2010 - 2013

STUDIES ON THE ROLE OF NK CELL RECEPTOR GENES AND THEIR LIGANDS IN THE DEVELOPMENT OF LEUKEMIA IN HUMANS

Lead researcher : Ali Ahmad
Co-researchers : Elie Haddad , Daniel Sinnett , Philip Awadalla , Michel Duval
Funding sources: IRSCC/Institut de recherche de la Société canadienne du cancer
Grant programs:
2008 - 2013

CRN-87521 CIHR TEAM OF PREDICTION AND COMMUNICATION OF FAMILIAL RISK OF BREAST CANCER

Lead researcher : Jacques Simard
Co-researchers : Christine Maugard , Bartha Maria Knoppers , Daniel Sinnett , Bernard Lespérance , Denise Avard
Funding sources: IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs:
2008 - 2013

CIHR TEAM OF PREDICTION AND COMMUNICATION OF FAMILIAL RISK OF BREAST CANCER

Lead researcher : Bartha Maria Knoppers
Co-researchers : Christine Maugard , Daniel Sinnett , Bernard Lespérance , Denise Avard , Jacques Simard
Funding sources: IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs:
2008 - 2011

REGULATORY POLYMORPHISMS IN APOPTOSIS GENES AND SUSCEPTIBILITY TO CHILDHOOD LEUKEMIA

Lead researcher : Daniel Sinnett
2010

DEVELOPPEMENT DE DEMANDE: GENOMIC DETERMINANTS OF COMMON LONG-TERM TREATMENT EFFECTS IN CHILDHOOD ACUTE LYMPHOBLASTIC LEUKEMIA SURVIVORS

Lead researcher : Daniel Sinnett
2009

ATELIER GENOMIQUE FRSQ-NSFC, BEIJING, CHINA

Lead researcher : Daniel Sinnett , John David Rioux

Outreach

Publications and presentations

Disciplines

  • Molecular Biology
  • Oncology
  • Genetics

Areas of expertise

  • Bioinformatics
  • Leukemia
  • Cell
  • Cancer Diagnosis and Detection
  • Data mining
  • Gene Regulation and Expression
  • Suppressor Gene
  • Genes
  • Susceptibility Genes
  • Complex Trait Genetics
  • Cancer Genetics
  • Genetics and Heredity
  • Molecular Genetics
  • Genome
  • Genomics
  • Genotype and Phenotype
  • Genetic Diseases
  • Genetic Markers
  • DNA and RNA Chips
  • Polymorphism