Sylvie Hamel
Mathematics and computer science
- Directrice de département
-
Faculté des arts et des sciences - Département d'informatique et de recherche opérationnelle
- Professeure titulaire
-
Faculté des arts et des sciences - Département d'informatique et de recherche opérationnelle
André-Aisenstadt, room 3161
Media
Profile
Research expertise
Mes travaux de recherche se situent à l'interface entre l'informatique et les mathématiques avec des applications en biologie moléculaire. Plus particulièrement, je m'intéresse aux problèmes algorithmiques liés à l'analyse des données provenant du séquençage. Je m'intéresse plus particulièrement à la recherche efficace de mots et de motifs, au réarrangement de génomes et, plus récemment, au repliement de protéines en milieu aqueux. J'ai aussi des intérêts de recherche en informatique théorique, en combinatoire algébrique et en combinatoire des mots.
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Affiliations and responsabilities
Research affiliations
Research units
Responsable
Membre
Teaching and supervision
Teaching
Courses taught (current session only)
- BCM-70521 – Communication scientifique avancée 2.1
- BCM-70522 – Communication scientifique avancée 2.2
- BIN-1002 – Intégration biosciences et informatique
- BIN-70061 – Communication scientifique avancée 3.1
- BIN-70062 – Communication scientifique avancée 3.2
Programs
Student supervision
Theses and dissertation supervision (Papyrus Institutional Repository)
Combinaison de différents scores génétiques pour mieux évaluer l’impact des CNV sur la cognition
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Étude combinatoire et algorithmique de la médiane de permutations sous la distance de Kendall-Tau
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Étude algorithmique et combinatoire de la méthode de Kemeny-Young et du consensus de classements
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
Étude de la médiane de permutations sous la distance de Kendall-Tau
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Analysing artefacts dependencies to evolving software systems
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
Evaluating Design Decay during Software Evolution
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
Quantification de la relation séquence-activité de l’ARN par prédiction de structure tridimensionnelle
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
Modeling protein evolution using secondary structures
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Analyse de la corrélation conditionnelle dérivée de la coévolution d’un système de trois gènes par un modèle du maximum de vraisemblance
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Algorithmes pour la réconciliation d’un arbre de gènes avec un arbre d’espèces
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
Helix Explorer : une nouvelle base de données de structures de protéines
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
De nouveaux algorithmes de tri par transpositions
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Parcours de parents immigrants dont le fils a fait l'expérience d'un gang de rue et d'une institutionnalisation : vécu familial bouleversé
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Algorithme de comparaison de structures secondaires d'ARN
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
L'intervention face au phénomène des gangs : l'exemple du Centre jeunesse de Montréal - Institut universitaire
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Application d'algorithmes de bio-informatique à la recherche de patrons de conception
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Projects
Research projects
Centre de recherches mathématiques (CRM)
Algorithmic and combinatorial problems inspired by comparative genomics.
FGR CRSNG en lien avec RN000686
CENTRE DE RECHERCHES MATHEMATIQUES (CRM)
Supplément COVID-19 CRSNG_Algorithmic and combinatorial problems inspired by comparative genomics.
ALGORITHMIC AND COMBINATORIAL STUDIES INSPIRED BY PROGBLEMS OF COMPARATIVE GENOMICS
Réseau Franco-Québécois de recherche sur l'ARN
CENTRE DE RECHERCHES MATHEMATIQUES (CRM)
ALGORITHMIC AND COMBINATORIAL STUDIES INSPIRED BY PROGBLEMS OF COMPARATIVE GENOMICS
Outreach
Publications and presentations
Disciplines
- Computer Science
- Pure Mathematics
- Molecular Biology
- Genomics
Areas of expertise
- Combinatorial analysis
- Combinatorics on words
- Comparative genomics
- Combinatorial geometry
- Combinatory logic
- Combinatorial optimization
- Pattern-matching for biological sequences
- Combinatorial set theory
- Combinatorial group theory
- Combinatorial number theory
- Combinatorial topology
- Genome sequencing