Passer au contenu

/ Research

Je donne

Rechercher

Natural Sciences and Engineering; Applied Sciences

Guy Wolf

Professeur adjoint

Faculté des arts et des sciences - Département de mathématiques et de statistique

André-Aisenstadt, room 6165

514 343-6694

guy.wolf@umontreal.ca

Profile

Research expertise

Mes sujets de recherche se situent à l'intersection de l'apprentissage automatique, des sciences des données et des mathématiques appliquées. En particulier, je suis intéressé par les méthodes d'exploration des données qui utilisent l'apprentissage des variétés et l'apprentissage profond géométrique. Je m'intéresse aussi aux applications d'analyse exploratoire des données biomédicales, surtout ceux qui portent sur les données de cellules uniques (p.ex. scRNA-seq et CyTOF).

Biography

Guy Wolf est professeur adjoint au département de mathématiques et de statistique de l’Université de Montréal. Ses sujets de recherche se situent à l’intersection de l’apprentissage automatique, de la science des données et des mathématiques appliquées. Il s’intéresse en particulier aux méthodes d’exploration des données qui utilisent l’apprentissage des variétés et l’apprentissage profond géométrique, ainsi qu’aux applications d’analyse exploratoire des données biomédicales, surtout ceux qui portent sur les données de cellules uniques (p.ex. scRNA-seq et CyTOF).

Affiliations and responsabilities

Research affiliations

Teaching and supervision

Student supervision

Theses and dissertation supervision (Papyrus Institutional Repository)

2023

Taxonomy of datasets in graph learning : a data-driven approach to improve GNN benchmarking

Graduate : Cantürk, Semih
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
2023

Exploratory and predictive methods for multivariate time series data analysis in healthcare

Graduate : Aumon, Adrien Andréas
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
2022

Parametric Scattering Networks

Graduate : Gauthier, Shanel
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
2020

Optimizing ANN Architectures using Mixed-Integer Programming

Graduate : ElAraby, Mostafa
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.

Projects

Research projects

2023 - 2030

Combining Space, Time, and cell types to decode and explain the effect sizes of rare genomic variants on cognition and psychopathology

Lead researcher : Sébastien Jacquemont
Co-researchers : Guy Wolf , Guillaume Dumas , Tomas Paus , Celia Greenwood
Funding sources: IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs: PVXXXXXX-(PJT) Subvention Projet
2022 - 2029

Centre de recherches mathématiques (CRM)

Lead researcher : Octavian Cornea
Co-researchers : Yoshua Bengio , François Lalonde , Gilles Brassard , Michel Delfour , Marlène Frigon , Véronique Hussin , Christiane Rousseau , Jacques Bélair , Paul M Gauthier , Sabin Lessard , Alain Vinet , Nadia El-Mabrouk , Gena Hahn , Christian Léger , Fahima Nekka , Iosif Polterovich , Yvan Saint Aubin , Andrew Granville , Sylvie Hamel , Manuel Morales , François Perron , Mylène Bédard , Pierre Duchesne , Matilde Lalin , Robert Gwyn Owens , Manu Paranjape , Dana Schlomiuk , Luc Vinet , Hugo Chapdelaine , Mireille Schnitzer , Karim Jerbi , Alexander Fribergh , Alejandro Murua , Maciej Augustyniak , Benoît Mâsse , Dimitrios Koukoulopoulos , Jun Li , Benjamin Seamone , William Witczak-Krempa , Egor Shelukhin , Morgan Craig , Guillaume Lajoie , Margarida Carvalho , Guy Wolf , Florian Maire , Frédéric Dupont-Dupuis , Michael C. Mackey , Frédéric Lesage , Russell Steele , Erica Moodie , Paul François , Henri Darmon , Maxime Descoteaux , Prakash Panangaden , André Dieter Bandrauk , Peter Bartello , Chantal David , Jean-Marc Lina , Anthony Raymond Humphries , John P. Harnad , Jacques Claude Hurtubise , Pengfei Guan , John A Toth , Niky Kamran , Adrian Iovita , Eyal Goren , Dmitry Jakobson , Vojkan Jaksic , Daniel Tzvi Wise , André Garon , Éric P. Marchand , Debbie Janice Dupuis , Yogendra Chaubey , Pawel Gora , Hershy Kisilevsky , Galia Dafni , D. Korotkin , Marco Bertola , Alina Stancu , Lea Popovic , Ibrahim Assem , Tomasz Kaczynski , Shiping Liu , Vasilisa Shramchenko , Bruno L. Rémillard , Richard Fournier , Alfred Michel Grundland , David Stephens , Xiaowen Chang , Frederic Guichard , Erik P. Cook , Robert Brandenberger , Adrian Vetta , Keshav Dasgupta , Christophe Grova , Gantumur Tsogtgerel , Johanna Neslehova , Jean-Christophe Nave , Anmar Khadra , Adam M. Oberman , Michael Yves Michel Pichot , Alexander Maloney , Dana Louigi Addario-Berry , José Garrido , Alexei Kokotov , Wei Sun , Patrice Gaillardetz , Linan Chen , Piotr Przytycki , Vladimir Makarenkov , Louis-Paul Rivest , François Bergeron , Steven P. Boyer , Line Baribeau , Frédéric Gourdeau , Claude Levesque , Thomas Joseph Ransford , Jean-Marie De Koninck , Javad Mashreghi , Thierry Duchesne , Srecko Brlek , Christophe Reutenauer , Vestislav Apostolov , Steven Lu , Geneviève Lefebvre , Hélène Cossette , Étienne Marceau , José Manuel Urquiza , Michael Lau , Alexandre Girouard , Antonio Lei , Jean-François Renaud , Christophe Hohlweg , Mathieu Boudreault , FRANCO SALIOLA , Alexandre Roch , Frédéric Rochon , Alexandre Blondin-Massé , Clement Hyvrier , Denis Talbot , Alexandre Bureau , Fabrice Larribe , Aurélie Labbe , Cody Hyndman , Khader Khadraoui , Hamed Hatami , Roger Villemaire , Frédéric Godin , Marcin Sabok , Yi Yang , Anne Mackay , Jérôme Vétois , Ting-Huei Chen , Habib Benali , Taoufik Bouezmani , Christian Genest , Xiaowen Zhou , Sorana Froda , Mélina Mailhot , Alexandra Schmidt , Simon Philippe Caron-Huot , Abdoulaye Banire Diallo , Jean-Philippe Lessard , Sarah Harrison , Anne-Sophie Charest , Masoud Asgharian-Dastenael , Rustum Choksi , Abbas Khalili Mahmoudabadi , Simon Gravel , Arusharka Sen , Arthur Charpentier , Mathieu Pigeon , Benoit Larose , Thomas Brüstle , Laurent Charlin , Janosch Ortmann , Tim Hoheisel , Jean Deteix , Jessica Lin , Michael Lipnowski , Giovanni Rosso , Thomas Hugh , Jean-Philippe Burelle , Julien Keller , Félix Camirand Lemyre , Marie-Pier Côté , Damir Kinzebulatov , Duncan McCoy , Klaus Herrmann , Felix Kwok , Courtney Paquette , Anush Tserunyan , Suresh Krishna , Valentino Tosatti , Patrick Brodie Allen , Behrooz Yousefzadeh , Marc-Hubert Nicole , Rober Platt
Funding sources: FRQNT/Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FQRNT)
Grant programs: PVXXXXXX-(RS) Programme de regroupements stratégiques
2021 - 2027

Representation learning and exploration of data geometries

Lead researcher : Guy Wolf
Funding sources: CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs: PVXXXXXX-(DGECR) Tremplin vers la découverte
2021 - 2027

Representation learning and exploration of data geometries

Lead researcher : Guy Wolf
Funding sources: CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs: PVX20965-(RGP) Programme de subvention à la découverte individuelle ou de groupe
2023 - 2026

Multiscale data geometric networks for learning representations and dynamics of biological systems

Lead researcher : Smita Krishnaswamy
Co-researchers : Guy Wolf
Funding sources: National Science Foundation
Grant programs:
2023 - 2026

Vers une meilleure compréhension et une utilisation efficace du calcul en profondeur dans les réseaux de neurones modernes

Lead researcher : Guy Wolf
Co-researchers : Danica Sutherland , Eugene Belilovsky
Funding sources: CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs: PVXXXXXX-Programme NOVA pour chercheur(e)s de la relève (partenariat avec FRQNT)
2023 - 2026

Vers une meilleure compréhension et une utilisation efficace du calcul en profondeur dans les réseaux de neurones modernes

Lead researcher : Guy Wolf
Co-researchers : Danica Sutherland , Eugene Belilovsky
Funding sources: FRQNT/Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FQRNT)
Grant programs: PVXXXXXX-Programme NOVA pour chercheur(e)s de la relève (partenariat avec CRSNG)
2021 - 2025

Representation learning and exploration of data geometries

Lead researcher : Guy Wolf
Funding sources: CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs: PVXXXXXX-(MDN) Supplément aux subventions à la découverte
2022 - 2024

Diffusion Geometry & Topology Approach to Data Fusion and Mitigating Batch Effects

Lead researcher : Guy Wolf
Funding sources: SPIIE/Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements
Grant programs: PVXXXXXX-Fonds d'excellence en recherche Apogée Canada/Bourse
2021 - 2024

Exploitation de structures de graphes dans les réseaux de neurones par transformée de scattering géométrique

Lead researcher : Guy Wolf
Funding sources: FRQNT/Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FQRNT)
Grant programs: PVXXXXXX-(NC) Établissement de la relève professorale
2021 - 2024

Geometry preserving deep networks

Lead researcher : Guy Wolf
Funding sources: SPIIE/Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements
Grant programs: PVXXXXXX-Fonds d'excellence en recherche Apogée Canada/Bourse
2019 - 2024

Finding emergent structure un multi-sample biological data with the dual geometry of cells and features

Lead researcher : Matthew J. Hirn
Co-researchers : Guy Wolf
Funding sources: NIH/National Institutes of Health (NIH)
Grant programs: PVXXXXXX-Subvention de recherche
2023

Des données pour raconter // Vincent Chrétien

Lead researcher : Guy Wolf
Funding sources: SPIIE/Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements
Grant programs: PVXXXXXX-Fonds d'excellence en recherche Apogée Canada/Bourse
2020 - 2023

Unified approach to graph structure utilization in data science

Lead researcher : Guy Wolf
Funding sources: SPIIE/Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements
Grant programs: PVXXXXXX-Fonds d'excellence en recherche Apogée Canada/Projet de recherche
2018 - 2022

Programme de fonds de démarrage et d'opération pour professeure IVADO - Compte pour le fonds d'opération - Guy Wolf

Lead researcher : Guy Wolf
Funding sources: SPIIE/Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements
Grant programs: PVXXXXXX-Fonds d'excellence en recherche Apogée Canada/Fonds démarrage et opération
2021

Integreted data-driven approaches for understanding immunological data

Lead researcher : Guy Wolf
Funding sources: SPIIE/Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements
Grant programs: PVXXXXXX-Fonds d'excellence en recherche Apogée Canada/Bourse
2020

PHATE-NET

Lead researcher : Guy Wolf
Funding sources: SPIIE/Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements
Grant programs: PVXXXXXX-Fonds d'excellence en recherche Apogée Canada/Bourse
2019

Probing learned network structure in a multi-task setting

Lead researcher : Guy Wolf
Funding sources: SPIIE/Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements
Grant programs: PVXXXXXX-Fonds d'excellence en recherche Apogée Canada/Bourse
2018 - 2019

Programme de fonds de démarrage et d'opération pour professeure IVADO - Compte pour le fonds de démarrage - Guy Wolf

Lead researcher : Guy Wolf
Funding sources: SPIIE/Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements
Grant programs: PVXXXXXX-Fonds d'excellence en recherche Apogée Canada/Fonds démarrage et opération

Outreach

Publications and presentations

Disciplines

  • Applied Mathematics
  • Pure Mathematics
  • Biomedical Sciences

Areas of expertise

  • Computer Databases
  • Learning Modes
  • Data mining
  • Biomedical Technologies
  • COVID-19
  • COVID19